Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRG4Q92954 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms