Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEO1Q92859 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEO1Q92859 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEO1Q92859 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEO1Q92859 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEO1Q92859 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEO1Q92859 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEO1Q92859 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEO1Q92859 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEO1Q92859 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEO1Q92859 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEO1Q92859 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEO1Q92859 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEO1Q92859 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEO1Q92859 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEO1Q92859 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEO1Q92859 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEO1Q92859 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEO1Q92859 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms