Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms