Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL2Q92772 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDKL2Q92772 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDKL2Q92772 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDKL2Q92772 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL2Q92772 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL2Q92772 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL2Q92772 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL2Q92772 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL2Q92772 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL2Q92772 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL2Q92772 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL2Q92772 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL2Q92772 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL2Q92772 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL2Q92772 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL2Q92772 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL2Q92772 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL2Q92772 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL2Q92772 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL2Q92772 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL2Q92772 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL2Q92772 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL2Q92772 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL2Q92772 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL2Q92772 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL2Q92772 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL2Q92772 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL2Q92772 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL2Q92772 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL2Q92772 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL2Q92772 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL2Q92772 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL2Q92772 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL2Q92772 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL2Q92772 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL2Q92772 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL2Q92772 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL2Q92772 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL2Q92772 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL2Q92772 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL2Q92772 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL2Q92772 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL2Q92772 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms