Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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