Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms