Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC12Q8WVT3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms