Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV28

BLNK, B-cell linker protein, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLNKQ8WV28 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BLNKQ8WV28 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BLNKQ8WV28 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms