Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4CQ8WTT0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLEC4CQ8WTT0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms