Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC4Q8TBB5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms