Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP61Q8NHU2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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