Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELBQ8NG08 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HELBQ8NG08 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HELBQ8NG08 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HELBQ8NG08 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HELBQ8NG08 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HELBQ8NG08 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HELBQ8NG08 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HELBQ8NG08 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HELBQ8NG08 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HELBQ8NG08 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HELBQ8NG08 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HELBQ8NG08 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms