Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP35Q8NFH5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms