Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms