Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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TMIEQ8NEW7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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TMIEQ8NEW7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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TMIEQ8NEW7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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TMIEQ8NEW7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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TMIEQ8NEW7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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TMIEQ8NEW7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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TMIEQ8NEW7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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TMIEQ8NEW7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIEQ8NEW7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIEQ8NEW7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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