Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG8Q8ND04 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms