Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD1Q8NBU5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms