Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms