Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms