Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RPAP2Q8IXW5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms