Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC65Q8IXS2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms