Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms