Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMC3Q7Z5M5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms