Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMC4Q7Z404 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMC4Q7Z404 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMC4Q7Z404 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMC4Q7Z404 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMC4Q7Z404 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC4Q7Z404 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMC4Q7Z404 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMC4Q7Z404 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMC4Q7Z404 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMC4Q7Z404 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMC4Q7Z404 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMC4Q7Z404 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMC4Q7Z404 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMC4Q7Z404 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMC4Q7Z404 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMC4Q7Z404 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMC4Q7Z404 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMC4Q7Z404 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMC4Q7Z404 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMC4Q7Z404 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms