Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC46A3Q7Z3Q1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC46A3Q7Z3Q1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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