Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CATSPER4Q7RTX7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CATSPER4Q7RTX7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CATSPER4Q7RTX7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CATSPER4Q7RTX7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CATSPER4Q7RTX7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CATSPER4Q7RTX7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CATSPER4Q7RTX7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPER4Q7RTX7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms