Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX7Q7RTT5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms