Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARCQ7LC44 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms