Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC80Q76M96 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC80Q76M96 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC80Q76M96 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC80Q76M96 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC80Q76M96 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms