Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms