Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms