Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP50Q70EL3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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