Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS12Q6ZW61 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms