Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms