Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms