Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIAT1Q6ZQX7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms