Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms