Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L3Q6VB84 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms