Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms