Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
METAP1DQ6UB28 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms