Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A10Q6U841 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms