Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms