Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZBED9Q6R2W3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms