Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATAD2Q6PL18 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATAD2Q6PL18 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATAD2Q6PL18 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATAD2Q6PL18 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATAD2Q6PL18 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ATAD2Q6PL18 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATAD2Q6PL18 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATAD2Q6PL18 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATAD2Q6PL18 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATAD2Q6PL18 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATAD2Q6PL18 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATAD2Q6PL18 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms