Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP1Q6PKG0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LARP1Q6PKG0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms