Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms