Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms