Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms