Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC8Q6A555 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms