Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CARMIL1Q5VZK9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms